微量元素在动物机体内可以作为一种免疫调节剂，对体液免疫和细胞免疫都有明显的改善，但是过量锰亦可以引起免疫系统的损伤。Son评估了锰和镁在大鼠体内作为一种免疫调节剂的有效性。其将大鼠分为三组，分别给予不同锰、镁水平的饲粮（１组0.05%Mg，0.01%Mn；２组0.1％Mg，0.001%Mn；３组0.05%Mg，0.01%Mn），研究显示高剂量镁和高剂量锰组的免疫功能受到显著影响，大鼠脾脏NK细胞和腹腔巨噬细胞的杀伤活性显著增加。George等饲喂不同形式的Zn、Mn、Cu和Co研究犊牛接种传染性牛鼻气管炎病毒后的免疫反应，发现在接种14d（p＜0.01）和28d（p＜0.05）后饲粮添加有机微量元素与无机微量元素相比显著提高了犊牛的细胞免疫反应，发病率降低了17.2％（p＜0.05）。但是过量锰对免疫器官的损伤也是显著的，Liu等在不同组的公鸡饲粮中分别添加600、900和1800mg/kg的MnCl₂研究过量锰对禽类免疫器官的影响，发现过量锰通过改变抗氧化防御系统，脂质过氧化和细胞调亡等途径导致禽类免疫系统氧化损伤。