骨骼是动物体内重要的储锰器官，长期缺锰对动物骨骼的多种细胞有不良影响，包括成骨细胞的减少和破骨细胞活性降低。禽类缺锰发生滑腱症和软骨营养障碍，绵羊缺锰会出现站立和行走困难，关节疼痛。Wang等将90只１日龄ＡＡ雏鸡分三组，其中两个缺锰组（40mg/kg和8.7mg/kg），—个对照组（60mg/kg）。测试评估血清中PTH、CT、ALP、TrACP、HOP、TNF-alpha、OC、Mn和Ca的水平，发现CT、ALP、TrACP、HOP和Mn的水平显著降低（p＜0.05），而PTH、CT和TNF-alpha显著升高（p＜0.05）。这说明Mn缺乏能引起血清中骨调节激素和骨代谢酶紊乱，使骨骼发育障碍。Yildiz等研究发现蛋鸡补充有机锰对体重増长、机体微量元素分布的改善、蛋重和骨硬度有积极影响。Wang等的另一试验还发现低锰饲粮能够显著降低细胞増殖区宽度和Bcl-２mRNA表达水平，而同时显著促进软骨细胞的凋亡及增加p21基因的表达水平。说明缺锰一方面抑制软骨细胞的増殖另一方面又促进软骨细胞调亡，两方面共同对软骨细胞的生长产生不利影响。